กองกิจการขนส่ง แบ่งการทำงานเป็น 2 ฝ่าย และ 1 งาน คือ 1. ฝ่ายบริหารงานขนส่ง 2. ฝ่ายตรวจสอบและซ่อมบำรุง และงานธุรการ

 1. ฝ่ายบริหารงานขนส่ง มีหน้าที่รับผิดชอบเกี่ยวกับงานจัดทำยุทธศาสตร์ แผนงานด้านการขนส่ง งานจัดระเบียบการขนส่ง งานด้านทำแผนปฏิบัติงานประจำเดือน ประจำปี งานรายงานผลการปฏิบัติงานการบริหารสถานีขนส่งในความรับผิดชอบ งานจัดให้มีบริการรถรับจ้าง งานจัดหาดูแลและซ่อมแซมบำรุงรักษาอาคาร สถานีขนส่งและวัสดุอุปกรณ์ต่าง ๆ งานจัดระเบียบจรารจร เส้นจราจร งานพื้นที่ลานจอดรถ งานติดตั้งและซ่อมบำรุงเครื่องหมายจราจร เส้นจราจร งานบริหารลานจอดรถ งานจัดสรรช่องจอดรถโดยสารประจำทางและรถรับ - ส่ง ผู้ใช้บริการงานประชาสัมพันธ์ข้อมูลเดินทาง ข้อควรปฏิบัติแก่ผู้ใช้บริการงานควบคุมจัดระเบียบ การติดตั้งป้ายประชาสัมพันธ์ต่าง ๆ งานจัดให้มีบริการจำหน่ายอาหาร เครื่องดื่มและสินค้าเบ็ดเตล็ด งานจัดให้มีการฝากของชั่วคราว การจัดให้มีบริการรถเข็น สัมภาระ การจัดทำหรือช่วยจัดงบประมาณ งานการเงินและบัญชี งานจัดทำแผนการใช้จ่ายเงินการจัดเก็บรายได้ การรับเงิน การเบิกจ่ายเงิน การเก็บรักษาเงิน จัดทำฎีกาเบิกจ่ายเงิน ควบคุมการเบิกจ่ายเงิน ควบคุมการเบิกจ่ายงบประมาณรายจ่ายประจำปี งานควบคุมการเบิก – จ่ายตั๋วโดยสาร จำหน่ายตั๋วโดยสารการเก็บรักษาขั้วตั๋วโดยสาร รายงานการใช้ตั๋วโดยสาร งานจัดเก็บค่าธรรมเนียม งานพัสดุ งานควบคุมภายใน งานส่งเสริมสนับสนุนประสานงานกับหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง งานบริการ ข้อมูล สถิติ ช่วยเหลือให้คำแนะนำทางวิชาการ งานพัฒนาระบบขนส่งทางราง งานพัฒนาระบบการขนส่งโลจิสติกส์ งานอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องและที่ได้รับมอบหมาย โดยฝ่ายบริหารงานขนส่ง จะแบ่งออกเป็น 2 งาน คือ  1. งานวิชาการขนส่ง และ 2. งานการเงินและบัญชี

1.1 งานวิชาการขนส่ง มีหน้าที่รับผิดชอบเกี่ยวกับงานจัดทำยุทธศาสตร์ แผนงานด้านขนส่ง งานจัดระเบียบการขนส่ง งานจัดทำแผนปฏิบัติงานประจำเดือน ประจำปี งานรายงานผลการปฏิบัติงาน การบริหารสถานีขนส่งในความรับผิดชอบ งานจัดให้มีบริการรถรับจ้าง งานจัดหาดูแลและซ่อมบำรุงรักษาอาคาร สถานีขนส่งและวัสดุอุปกรณ์ต่าง ๆ งานจัดระเบียบจราจร เส้นจราจร งานพื้นที่ลานจอดรถ งานติดตั้งและซ่อมบำรุงเครื่องหมายจราจร เส้นจราจร งานพื้นที่ลานจอดรถ งานติดตั้งและซ่อมแซมบำรุงเครื่องหมายจราจร เส้นจราจร งานบริหารลานจอดรถ งานจัดสรรช่องจอดรถโดยสารประจำทางและรถรับ - ส่งผู้ใช้บริการงานรักษาความปลอดภัย งานรักษาความสะอาด งานประชาสัมพันธ์ข้อมูลเดินทาง ข้อควรปฏิบัติแก่ผู้ใช้บริการ งานควบคุมจัดระเบียบ การติดตั้งป้ายประชาสัมพันธ์ต่าง ๆ งานจัดบริการห้องสุขา การจัดทำหรือช่วยจัดทำงบประมาณ งานส่งเสริมสนับสนุนประสานงานกับหน่วยงานอื่นๆที่เกี่ยวข้อง งานบริการข้อมูล สถิติ ช่วยเหลือให้คำแนะนำทางวิชาการ งานพัฒนาระบบขนส่งทางราง งานพัฒนาระบบการขนส่งโลจิสติกส์ ตลอดจนงานอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องและได้รับมอบหมาย

1.2 งานการเงินและบัญชี มีหน้าที่ความรับผิดชอบเกี่ยวกับงานจัดให้มีบริการจำหน่ายอาหาร เครื่องดื่มและสินค้าเบ็ดเตล็ด งานจัดให้มีการฝากของชั่วคราว การจัดให้มีบริการรถเข็น สัมภาระ งานการเงินและบัญชี งานจัดทำแผนการใช้จ่ายเงิน การจัดเก็บรายได้ การรับเงิน การเบิกจ่ายเงิน การเก็บรักษาเงิน จัดทำฎีกาเบิกจ่ายเงิน ควบคุมการเบิกจ่ายเงิน ควบคุมการเบิกจ่ายงบประมาณ รายจ่ายประจำปี งานควบคุมการเบิก-จ่ายตั๋วโดยสาร การจำหน่ายตั๋วโดยสาร การเก็บรักษาต้นขั้วตั๋วโดยสาร รายงานการใช้ตั๋วโดยสาร งานจัดเก็บค่าธรรมเนียมต่าง ๆ งานพัสดุ  งานควบคุมภายใน ตลอดจนงานอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องและได้รับมอบหมาย

 2. ฝ่ายตรวจสอบและซ่อมบำรุง มีหน้าที่ความรับผิดชอบเกี่ยวกับงานตามกฎหมายว่าด้วยการขนส่งทางบกและทางน้ำ งานศึกษาเส้นทางคมนาคมเพื่อขอกำหนด ปรับปรุงและยกเลิกเส้นทาง งานไฟฟ้าส่องสว่าง งานวางแผนควบคุมการใช้ยานพาหนะ งานตรวจสอบยานพาหนะ งานช่อมแซมบำรุงรักษายานพาหนะ เครื่องยนต์ เครื่องจักร งานควบคุมประวัติซ่อมยานพาหนะ งานควบคุมการเบิกจ่ายน้ำมันเชื้อเพลิงและน้ำมันหล่อลื่นต่างๆ ตลอดจนงานอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องและที่ได้รับมอบหมาย โดยฝ่ายตรวจสอบและซ่อมบำรุง จะแบ่งออกเป็น 2 งาน คือ   

2.1 งานปฏิบัติการขนส่ง มีหน้าที่ความรับผิดชอบเกี่ยวกับงานตามกฎหมาย ว่าด้วยการขนส่งทางบกและทางน้ำ งานศึกษาเส้นทางคมนาคม เพื่อขอกำหนดปรับปรุงและยกเลิกเส้นทาง งานควบคุมการเบิกจ่ายน้ำมันเชื้อเพลิงและน้ำมันหล่อลื่นต่างๆ ตลอดจนงานอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องและได้รับมอบหมาย     

2.2 งานซ่อมบำรุง มีหน้าที่ความรับผิดชอบงานไฟฟ้าส่องสว่าง งานซ่อมแซมบำรุงรักษายานพาหนะเครื่องยนต์ เครื่องจักร งานควบคุมประวัติซ่อมยานพาหนะ งานวางแผนควบคุมการใช้ยานพาหนะ งานตรวจสอบยานพาหนะ ตลอดจนงานอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องและที่ได้รับมอบหมาย

 งานธุรการ

มีหน้าที่รับผิดชอบ งานสารบรรณ งานแจ้งเวียนหนังสือ ร่างโต้ตอบหนังสือ งานเก็บรักษารวบรวมระเบียบข้อกฎหมาย หนังสือสั่งการที่เกี่ยวข้อง งานรักษาความปลอดภัย งานรักษาความสะอาด งานจัดบริการห้องสุขา งานรับส่งหนังสือ งานจัดทำคำสั่ง ประกาศต่างๆ จัดระเบียบวาระการประชุม งานควบคุมดูแลและเก็บรักษาพัสดุครุภัณฑ์ งานทำลายหนังสือประจำปี การใช้รถยนต์ส่วนราชการ งานสวัสดิการของข้าราชการและพนักงานจ้าง งานขออนุมัติจัดซื้อจัดจ้าง งานช่วยจัดทำข้อบัญญัติประจำปี งานช่วยจัดทำงบประมาณรายจ่ายเพิ่มเติมและงานโอนแก้ไขเปลี่ยนแปลงงบประมาณ งานพัสดุ ตลอดจนงานอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องและที่ได้รับมอบหมาย